Minst 173 civila har dödats i anfallen sedan den 1 juni, enligt FN, som befarar att den verkliga siffran kan vara mycket högre.
“Civila får inte offras för snabba militära framgångar", säger FN:s människorättskommissionär Zeid Ra'ad al-Hussein i ett uttalande.
De intensiva bombardemangen mot al-Raqqa "under de tre senaste veckorna rapporteras ha lämnat civila skräckslagna och osäkra på var de kan söka skydd, fångade mellan IS monstruösa grymhet och den hårda kampen för att besegra den", fortsätter han.
IS försöker hindra civila från att fly och de som lyckas ta sig ut riskerar att dödas av landminor eller hamna i korseld.
FN uppmanar de olika styrkor som ingår i alliansen mot IS att följa folkrätten, bland annat att vidta alla tillgängliga åtgärder för att undvika förluster bland civilbefolkningen.
I uttalandet säger FN:s människorättskommissarie också att det finns oroande rapporter om övergrepp utförda av kurdisk-arabiska rebellalliansen SDF. Miliser som ingår i SDF anklagas för plundring, kidnappningar och rekrytering av barn i områden som de kontrollerar, bland annat i staden Tabqa som erövrades under offensiven mot al-Raqqa.
TT
Före revolutionen var al-Raqqa i norra Syrien en helt vanlig syrisk stad där invånarna brottades med typiska problem som låga löner, arbetslöshet och politisk repression. Den terrorstämplade extremistgruppen Islamiska staten (IS) utropade i juni 2014 al-Raqqa till huvudstad i sitt självutnämnda kalifat, några månader efter att ha tagit kontrollen där.
Då blev allt annorlunda. Jihadisternas extremt stränga tolkning av islamisk lag förvandlade staden till en främmande plats, med halshuggningar, piskstraff och utbrett kvinnoförtryck.
Den USA-ledda allians som kämpar mot IS uppskattar att det finns mellan 3000 och 4000 jihadister i al-Raqqa.