Mötet, som Frankrike är värd för, kommer att hållas som planerat på söndag med Belgien, Nederländerna, Tyskland och EU-kommissionen närvarande, enligt en källa nära den franske inrikesministern.
Att britterna stängs ute sker i protest mot att Storbritanniens premiärminister Boris Johnson på Twitter offentliggjort ett brev om migrantkrisen.
I brevet till Frankrikes president Emmanuel Macron föreslår Johnson att Frankrike tar tillbaka migranter som korsat Engelska kanalen. Enligt Johnson skulle detta "avsevärt minska – om inte stoppa – migrantströmmen över gränsen och spara tusentals liv".
Johnson föreslår också gemensamma gränspatruller, flygövervakning och att länderna delar underrättelser med varandra.
"Besvikelse"
Brevet är en "besvikelse", konstaterar Frankrikes inrikesminister Gerald Darmanin.
"Att göra det offentligt gör saken ännu värre. Därför måste jag ställa in vårt möte i Calais på söndag", skriver Darmanin i ett meddelande till sin brittiska motsvarighet Priti Patel.
President Emmanuel Macron uttalade sig om publiceringen av brevet som en "oseriös" metod under en presskonferens i samband med sin resa till Italien.
– Ledare kommunicerar inte med varandra i de här frågorna med hjälp av tweetar och brev som offentliggörs. Vi är inte visselblåsare, säger Macron och fortsätter:
– Kom igen, kom igen.
Storbritannien ber Frankrike att ompröva beslutet.
– Det ligger i vårt intresse. Det ligger i deras intresse, säger Storbritanniens transportminister Grant Shapps till BBC och tillägger att inget land kan ensamt lösa migrantkrisen.
En talesperson för Boris Johnson säger att premiärministern inte ångrar att han offentliggjorde brevet, och att allmänheten "med all rätt vill veta vad vi funderar på i syfte att lösa det här problemet".
27 miste livet
I veckan miste 27 migranter livet när de försökte ta sig över Engelska kanalen till Storbritannien, i den dödligaste olyckan hittills. Endast två överlevare har hittats kraftigt nedkylda, en irakier och en somalier, enligt Gerald Darmanin.
En polisutredning om mord har inletts. Fem misstänkta människosmugglare har gripits.