Tillsynsmyndigheten för medier, Roskomnadzor, anklagar oberoende medier som tv-kanalen Dozjd och tidningen Novaja Gazeta för att sprida "otillförlitlig socialt betydelsefull osann information", vad gäller beskjutningen av ukrainska städer och civila dödsfall. Medierna uppmanas att radera redan publicerad information.
Även radiokanalen Echo Moskvy hör till de anklagade medierna.
Den som bryter mot förbudet eller låter bli att radera information kommer att bötfällas eller blockeras, står det i ett uttalande från Roskomnadzor. Även en utredning angående "spridningen av otillförlitlig för allmänheten viktig information av ovanstående medier" har påbörjats, heter det vidare.
"Tillförlitlig" information finns i officiella ryska informationskanaler, tillägger Roskomnadzor. I Ryssland står majoriteten av medier under statens kontroll eller starka påverkan.
Enligt ukrainska uppgifter har närmare 200 civila dödsoffer krävts sedan Ryssland angrep Ukraina i gryningen torsdag morgon.
Ryssland har hittills inte offentliggjort några dödstal när det gäller ryska soldater. Från Kiev hävdas dock att man orsakat tunga förluster hos ryska styrkor.
Ryska medborgare har varnats för att demonstrera mot landets intåg i Ukraina. Myndigheterna hänvisar till den "spända politiska situationen". Under torsdagen uppges 1 400 personer ha gripits för att ha samlats till stöd för fred i ryska städer.